Avec le tournant du 20ème au 21ème siècle, la biologie a connu un changement d’échelle d’observation. Elle s’est intéressée aux mêmes objets que précédemment – molécules, cellules, organismes, populations, écosystèmes – mais en les appréhendant de façon holistique, grâce au développement de technologies visant à caractériser l’ensemble des composantes d’un système (génome, suivi du transcriptome, protéome, interactome, phénome). La bioinformatique est devenue l’indispensable compagne de cette évolution, en développant de nouveaux outils pour analyser, représenter et interpréter les données massives produites par ces technologies dites “omiques”. Dans quasiment tous ses domaines d’application, la biologie s’est transformée en une science des données.
Les cours magistraux dresseront un panorama des approches bioinformatiques actuelles et les illustrera par des applications à différents domaines de la biologie, en mettant l’accent sur la santé humaine et la biodiversité. Les travaux pratiques amèneront les étudiants à découvrir des outils bioinformatiques faciles d’accès (sans compétence prérequise en informatique) pour interroger les données afin de répondre à des questions biologiques ciblées.
Notions de biochimie: molécules du vivant (ADN, ARN, protéines, small compounds)Notions de biologie moléculaire (structure des gènes, mutations, hérédité).Notions de biologie cellulaireEvolution biologiquePrincipaux groupes taxonomiques du vivantNotions de base de mathématique (niveau lycée)Des gènes aux génomes 2h CMSéquence, structure et fonction des protéines 2h CMRetracer l’évolution à partir des séquences 2h CMGénomique personnalisée 2h CMExploration de la biodiversité 2h CMAnalyse des réseaux biologiques 2h CML'information au coeur du vivant 2h CMTravaux pratiques de bioinformatique 16h TP