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Licence Sciences de la vieUE Bioinformatique

Contenu

  • Domaines protéiques conservés
  • Alignements multiples
  • Phylogénie moléculaire
  • TD + Travail Personnel : annotation de fragments de séquences métagénomiques (TER Annotathon)

Compétences visées

L'unité pré-requise présente les outils de bioinformatique fondamentaux (banques de données, délimitation d'ORF et recherche de séquences homologues) appliqués avec des protocoles détaillés sur des séquences choisies. L'unité d'approfondissement BIO7 présentera d'une part de nouveaux outils bioinformatiques (identification de domaines protéiques conservés, alignements multiples et phylogénie), et fera d'autre part appliquer l'ensemble de ces outils dans des conditions réelles. Les étudiants concevront leur propre protocole d'analyse in silico qu’ils appliqueront directement en ligne dans un environnement pédagogique dédié (Annotathon) à plusieurs séquences biologiques anonymes (ADN environnementaux issus des projets de métagénomique). Les fiches de séquences annotées par les étudiants constituent un TER.

Langue utilisée

Langue principale utilisée par cet enseignement : Français.

Pré-requis obligatoires

Aucun.

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